Призрак в доспехах: У истоков онлайн

Действия аниме «Призрак в доспехах: У истоков» происходит в 2027 году. Прошел всего лишь год, после трагических событий - неатомной четвертой мировой войны. В Ньюпорт-Сити происходит взрыв бомбы. Этот террористический акт прервал жизнь человека, который продавал оружие. Сотрудники правоохранительных органов считают, что он был связан с организацией 501, которая не афиширует свои дела. Арамаки, состоящий на службе, которая обеспечивает безопасность местного населения, прибегает к помощи хакера Мотоко Кусанаги, полагая, что ему удастся пролить свет на эти ужасающие события. Агент сыска Тогуса, который занимается расследованием серийных убийств девушек, торгующих своим телом, считает, что эти события связаны между собой и пытается выявить связь. Детектив, предполагает, что Кусанаги и есть злоумышленник. Помимо полиции, за Кусанаги присматривает и полковник из системы 501.